O fluxograma é uma organização de atividades da empresa que pode ser analisada e resolução de problemas,pois ele vai te mostra aonde esta a causa do seu mau funcionamento e ai você toma medida mais cabível para uma resolução.
E o organograma é uma organizadora de cargos que possuem três níveis empresarial,ou seja, estratégico, tático, operacional. O ponto estratégico vai planejar como aumentar e melhora mais a empresa. O ponto tático são gerente de cada cargo pois ele são o equilíbrio da empresa, pois vão intermédia a conversa entre os operários e o cargo alto da empresa. O ponto operacional é mais importante, pois é ele que vai lidar com o publico pessoalmente, se ele atender bem a empresa vai bem e se por causa atender mal o publico a empresa vai mal devido este mau atendimento.
Veja o vídeo a seguir sobre a diferença entre fluxograma e organograma: